Il comando per cambiare directory in dos è cd [nome dir] ad es. cd temp.
Il problema è che se il file è in uso non riesci a cancellarlo neanche dal prompt dos e probabilmente neanche a spostarlo nel cestino.
Dovresti provare avviando il sistema in modalità provvisoria (che sist. operativo hai?) e poi provare a cancellare i file.
Altre possibilità sono in ordine di difficoltà:
1. Guarda se per caso c'è qualche programma sconosciuto nel menu Programmi -> Esecuzione automatica
2. Prova a cercare nel file C:\Windows\Win.ini se alla riga Run= c'è un riferimento ai file in questione
3. Prova a guardare nel Registry (con RegEdit) se alla chiave HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows\CurrentVersion\Run c'è un riferimento ai file in questione
Bye